Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SOX4Q06945 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms