Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC18A2Q05940 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms