Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms