Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms