Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms