Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms