Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms