Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1AP62834 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1AP62834 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1AP62834 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1AP62834 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1AP62834 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1AP62834 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1AP62834 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1AP62834 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1AP62834 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1AP62834 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1AP62834 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAP1AP62834 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAP1AP62834 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms