Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA9P57773 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA9P57773 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA9P57773 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA9P57773 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJA9P57773 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA9P57773 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA9P57773 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms