Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NRG3P56975 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms