Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CAV3P56539 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAV3P56539 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CAV3P56539 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAV3P56539 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAV3P56539 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAV3P56539 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAV3P56539 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAV3P56539 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAV3P56539 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms