Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGA8P53708 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms