Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms