Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTBP49356 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTBP49356 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms