Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms