Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP7BP35670 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP7BP35670 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms