Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCGF2P35227 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms