Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP6P35125 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP6P35125 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6P35125 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP6P35125 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP6P35125 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP6P35125 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms