Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA13P31271 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms