Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB5P28074 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms