Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IL3RAP26951 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms