Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYF6P23409 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYF6P23409 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms