Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XBP1P17861 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XBP1P17861 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XBP1P17861 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms