Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEFHP12036 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEFHP12036 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEFHP12036 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms