Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ODC1P11926 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms