Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms