Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RGPD2P0DJD1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms