Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00032P0C843 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms