Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PKHD1P08F94 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
PKHD1P08F94 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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