Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX7O95931 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX7O95931 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms