Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C6orf47O95873 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms