Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG7O95352 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG7O95352 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG7O95352 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG7O95352 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG7O95352 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG7O95352 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG7O95352 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG7O95352 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG7O95352 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms