Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRATO95237 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRATO95237 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRATO95237 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRATO95237 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRATO95237 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRATO95237 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRATO95237 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRATO95237 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms