Protein–RNA interactions for Protein: O75973

C1QL1, C1q-related factor, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL1O75973 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QL1O75973 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms