Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms