Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHE40O14503 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms