Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PCH4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PCH4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PCH4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PCH4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PCH4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PCH4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PCH4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PCH4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PCH4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PCH4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PCH4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms