Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATL2C9JE40 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms