Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms