Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WASHC1A8K0Z3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms