Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOBPA7XYQ1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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