Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX13Q9Y5W8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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SNX13Q9Y5W8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX13Q9Y5W8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms