Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB23Q9ULC3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms