Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms