Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYTH4Q9UIA0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYTH4Q9UIA0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms