Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTNNA3Q9UI47 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms