Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFDP1Q9UEE9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms