Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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