Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHPF2Q9P2E5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms