Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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